1. ينبوع المعرفة: وينقسم إلى
- a.علم الفلسفة والمنطق: يناقش فيه التحديات الفلسفية ويشرح دور الفلسفة (ارسطوا) بالنسبة إلى اللاهوت ويعتبر مقدمة لما يليه من أجزاء.
- b. أغلب الهرطقات وما قضيتها. (انتقد يوحنا الدمشقي شخصية الرسول محمد الذي يعتبره البعض تاريخياً من أوائل من كتبوا كتابا كاملا ضد شخصية الرسول والإسلام حيث ذكر في كتابه بأن الراهب النسطوري الراهب بحيرى قام بمساعدة الرسول محمد في كتابة القرآن، واتهم الرسول أيضا باقتباسه بعض من كتابات ورقة بن نوفل الذي كان وحسب زعم الدمشقي قساً نسطورياً كان يترجم بعض الأناجيل المحرفة إلى العربية.
- c. الأمانة الأرثوذكسية والإيمان الأرثوذكسي والمئة مقالة في الإيمان الأرثوذكسي. يتضمن عرضاً لأهم العقائد. الله الواحد، الاقانيم الثلاثة، الخلق، الملائكة، العالم، الانسان، التجسد، تكريم القديسين والايقونات …
2. مختصر الأمانة أنطاكية الأرثوذكسية: كتبه لإيليا مطران يبرود
3. مقالة عن الثالوث، وهي على طريقة سؤال وجواب
4. مقالة عن “قدّ،س قدّوس قدّوس” يبيّن أن هذه الصلاة موجّهة إلى الأقانيم الثلاثة وليس إلى الابن وحده.
5. مقدمة عامة عن العقائد: كتبها -جمعها تلاميذه عنه- إلى يوحنا مطران اللاذقية
6. ثلاث مقالات للدفاع عن الأيقونات المقدسة: كتبها بين سنتيّ 726 و730 بعد صدور المرسوم ضد تكريم الأيقونات المقدسة. وضع فيها يوحنا الاسس الاهوتية للدفاع عن تكريم الايقونات.
7. مقالة ضد أسقف يعقوبي: يرفض فيها آراء اليعاقبة ومبادئهم وخاصة قولهم أن في المسيح طبيعة واحدة.
8. مقال ضد المانوية: وهي بشكل حوار بين أرثوذكسي ومانوي لإظهار أخطاء الثنائية (الخير والشر).
9. جدال بين مسلم ومسيحي: يدافع فيه عن عقيدة التجسد ويرفض نظرية القضاء والقدر.
10. مقالة ضد الساحرات.
11. مقالة في الطبيعة المركبة: رفض لآراء القائلين بالطبيعة الواحدة.(النسا طرة).
12. مقالة في أن للمسيح إرادتين: وهي ردّ على القائلين بأن للمسيح إرادة واحدة.
13. مقالة ضد النساطرة: القائلين بأن للمسيح شخصين كما أنه له طبيعتين.
14. مجادلة يوحنا الأرثوذكسي: مع مانوي يرفض أفكار ماني
15. مؤلف في شرح رسائل القديس بولس. وقد استوحى فيه من كتابات يوحنا الذهبي الفم وكيرلس الإسكندري.
16. مقالة قصيرة عن الصوم
17. مقالة عن الأرواح السيئة الثمانية: يعالج فيها الخطايا الرئيسية التي يرتكبها الراهب ضد الحياة الرهبانية.
18. مقالة في الفضائل والرذائل.
19. المواعظ: في رقاد السيدة وعن ولادة السيدة وعن التجلي والتينة اليابسة التي لعنها يسوع ويوم السبت العظيم ……………. إلخ
20. مؤلفات طقسية وأناشيد الدينية واخصها للعذراء مريم (ان ابرايا … )
تحتفل كنيستنا الأرثوذكسية بتذكاره في الرابع من شهر كانون الأول.
طروبارية باللحن الثامن
ظهرتَ أيها اللاهج بالله يوحنا، مرشداً إلى الإيمان المستقيم، ومعلّماً لحسن العبادة والنقاوة، يا كوكب المسكونة، وجمال رؤساء الكهنة الحكيم، وبتعاليمكَ أنرت الكل، يا معزفة الروح، تشفع إلى المسيح الإله أن يخلص نفوسنا.
وأيضاً طرويارية باللحن الثامن
هلموا نمتدح البلبل الغرّيد الشجي النغم، الذي أطرب كنيسةَ المسيح وأبهجها بأناشيده الحسنة الإيقاع الطلية أعني به يوحنا الدمشقي الكلي الحكمة، زعيم ناظمي التسابيح الذي كان مملوءاً حكمة إلهية وعالمية.
قنداق باللحن الرابع
لنسبّح أيها المؤمنون كاتب التسابيح معلّم الكنيسة ومصباحها، يوحنا الموقر، المقاوم الأعداء، لأنه حمل سلاح صليب الرب، فصادم به ضلالة المبتدعين كلها، وبما أنه شفيع حار عند الله، فهو يمنح الكل غفران الزلات.
قنداق آخر باللحن الثاني
لقد روضت جسدك وذللته بالكد في أتعاب النسك الكثيرة أيها الأب البار فحلّقت مرتقياً إلى العلو السماوي وفيه أعطيت الألحان الإلهية فرنمت بها علانية لأحباء الرب.