إجتمع أعضاء مركز دمشق في مؤتمر استثنائي يوم الجمعة بتاريخ 15/ 5 / 2009 وذلك لمناقشة وضع النظام الداخلي الخاص في حركة الشبيبة الأرثوذكسية في مركز دمشق.
أقرّ الأعضاء النظام الداخلي المعدّل بصيغته الجديدة، والتي عَمِل على وضعها مجموعة من الأخوة المقتدرين والمشهود لهم بالغيرة على العمل في الحركة.
والنظام الداخلي الخاص في مركز دمشق يبحث ضمن أبوابه مجموعة من المواد التي توضح مفاهيم أساسية ضمن الحركة كالمريدية والعضوية، وأيضاً يوضح المسؤوليات الإدارية والإرشادية ضمن المركز والفرع، ويبحث في تنظيم العمل في الحركة عن طريق، البحث في مفاهيم الفرقة والأسرة والفرع، ومن ثم المركز وتوضيح المسؤوليات المتعلقة بكل منها.
و من قرارات المؤتمر، إضافة مسؤولية إدارية جديدة في كل من مجلسي المركز و الفرع، و هي مسؤولية الإعلام.